挖掘MRSA遗传密码可以阻止超级爆发

日期:2019-01-25 06:05:01 作者:逄觋 阅读:

作者:Jessica Hamzelou第一次使用全基因组测序,MRSA爆发已经停止耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)无害地存在于鼻孔和大约1%人口的皮肤上但当细菌进入人体的血液和内脏时,它们会引起难以治疗的有问题的感染,使细菌获得“超级细菌”称号医院如何判断是否有MRSA爆发或一系列无关的感染目前,技术涉及对七种细菌基因进行测序,以确定哪种类型的MRSA已经定植或感染了一个人但是因为大多数人都有相同类型的MRSA,所以测试结果很少能够确认个体是否将病毒传播给对方英国剑桥Wellcome Trust Sanger研究所的Sharon Peacock说,对细菌的整个基因组进行测序可以提供更详细的图片,说明这些细菌来自何处当她的团队在剑桥Rosie医院的特殊护理婴儿单元中发现了几例MRSA病例时,他们决定使用全基因组测序来调查感染是否相关当医生注意到病房中有三例MRSA感染病例时,第一个红旗被抬起,要求对病房进行深层清洁该医院的感染控制小组将从每个婴儿中取出的细菌分离物与在过去六个月中筛查出MRSA阳性的13名婴儿的医院目录进行了比较所有新病例似乎都是由一种MRSA病毒引起的,类似于早期病例中有8例病例在深层清洁后四天,医生诊断出另一名患有MRSA的婴儿,这种婴儿在遗传上与引起三种最新病例中的两种的细菌相同为了确定新病例是独立的,相互关联的,还是与老年感染相关,Peacock的团队转向全基因组测序该小组的调查显示,在17例中,有14例似乎是由新的MRSA菌株引起的已知MRSA细菌经常发生突变当团队考虑到这种突变率以及每次MRSA感染的时间时,他们能够得出结论,14例是相关的研究报告的共同作者朱利安帕克希尔说:“最初的调查尚无定论,我们无法确定是否爆发”使用全基因组测序“我们立即能够说它们是一次爆发......并且几乎可以肯定病房已经发生传播”当团队将调查范围扩大到医院的婴儿单位后,他们确定了其他10个病例是由同一种菌株引起的 “他们是同一次爆发的一部分,”帕克希尔说然后,孔雀和她的同事试图找出所有这些人之间的共同因素他们,他们的医生或家人访问了哪些病房一个由154名员工组成的屏幕显示,一名患者携带相同的MRSA菌株 “我们可以相当确定地说工作人员参与了疫情,”帕克希尔说 “这对我们来说真的很令人兴奋 - 它让医院有机会进行干预”这名患者在返回工作岗位之前接受了防腐处理,以清除细菌该组织称,从那时起,该病房就没有MRSA感染了 “这是第一例全基因组测序技术导致临床干预并导致疫情爆发的案例,”Parkhill说该小组希望这种方法能够提供一种经济有效的工具,帮助医院控制感染的传播 “我认为,未来这将......与当前的方法一起使用,以改善患者护理并防止疾病暴发,”Peacock说 “这不仅仅是一个理论或研究工具 - 它可以改变患者护理”该团队估计,每个MRSA分离株的全基因组测序费用为50英镑到100英镑,尽管必须在之前进行官方成本效益分析更广泛地使用该技术 “这是我们可以将其作为常规工具的首批明确示范之一,”加拿大安大略省圭尔夫大学的斯科特·韦斯说 “这真的是未来的潮流”期刊参考文献:Lancet doi.org/jq9关于这些主题的更多信息: